Emilie Villar
Prestations en bioanalyses et génomique environnementale
À propos de moi
Jeune, je me suis intéressée aux plantes en général et aux arbres en particulier sous l'influence de mon grand-père, qui m'emmenait au potager avec lui et qui m’apprenait à reconnaitre les essences de bois dans son atelier de menuisier amateur. Ensuite, j'ai eu la chance de faire un stage assez tôt dans mon cursus au laboratoire de génétique forestière de l'INRA d'Avignon. Une passion était née, je ne jurais plus que par les gènes! J'aimais à la fois le côté minutieux du laboratoire et l'esprit mathématique nécessaire pour appréhender la discipline. J'ai donc poursuivi une formation universitaire en agronomie avec une spécialisation en génétique, et puis je suis partie travailler 2 ans en tant que Volontaire Internationale au Congo. Ensuite j'ai continué le travail commencé au Congo en passant une thèse à l'Université de Bordeaux. A cette époque (2010) la génomique était en train de vivre un grand tournant avec l'avènement du séquençage nouvelle génération à bas coût. Frustrée de ne pouvoir jouer moi-même avec mes données car il me fallait toujours l'intermédiaire d'un bioinformaticien, j'ai décidé, diplôme en poche, d'apprendre à coder pour pouvoir appréhender le nouvel or numérique: les Big Data! C'est ainsi que je me suis retrouvée à bord de Tara, la goélette qui a révolutionné nos connaissances du plancton en relevant le défi technique de séquencer l'inconnu présent dans les milliers de m³ d'eau de mer.
Mon Parcours
Chercheuse associée
Station Biologique de Roscoff (CNRS)
Mediterranean Institute of Oceanology, Marseille (CNRS)
Juin 2016 - Juin 2018
Dans le cadre du projet ANR IMPEKAB, j'ai coordonné la mise en place d'une essai au laboratoire sur des collodaires, un groupe de zooplancton symbiotique et colonial. Il s'agissait de tester leur réponse au stress thermique en étudiant à la fois leur physiologie (photosynthèse et respiration), leur anatomie (nombre de symbiontes, présence de vésicules virales, etc...) et leur expression de gènes (par RNA-Seq).
Chercheuse associée
Laboratoire IGS de Marseille (CNRS)
Institut de Biologie de l'ENS de Paris
Mai 2012 - Mai 2016
Scientifique associée à l'expédition Tara Oceans, ma spécificité était d'intégrer les différents types de données récoltées (metagenomique, imagerie, physico-chimique) pour répondre à des questions écologiques. J'ai travaillé sur 4 grands projets: 1. Les turbulances du courant des Aiguilles 2. La fertilisation autour des îles Marquises 3. Les virus géants marins (projet européen MicroB3) 4. Un site web regroupant les données de Tara Océans (Ocean Gene Atlas).
Doctorante
UMR BioGeCo de Bordeaux (INRA)
UMR AMAP de Montpellier (CIRAD)
CRDPI Pointe Noire (Rep. du Congo)
Janvier 2008 - Décembre 2011
Au cours de ma thèse, j'ai poursuivi une expérimentation sur eucalyptus que j'avais mis précédemment en place au Congo (mesures de physiologie végétales, prélèvement, entretien du dispositif). La 1ère année j'ai surtout travaillé au laboratoire de biologie moléculaire en séquençage et analyse d'expression de gènes. Les 2 années suivantes ont été consacrées à l'analyse statistique des données moléculaires et phénotypiques.
ingénieure
UMR AMAP de Montpellier (CIRAD)
CRDPI Pointe Noire (Rep. du Congo)
Décembre 2005 - Décembre 2007
Sous la supervision de chercheurs du CIRAD restés à Montpellier, je poursuivais le programme d'amélioration de l'eucalyptus en coordonnant le travail d'une équipe d'environ 10 personnes. Une partie de mon temps était consacrée à organiser la mise en place et le suivi des essais aux champs, et le reste du temps j'analysais le résultat des croisements de génétique quantitative.
Master II
Université Pierre et Marie Curie, Paris
Septembre 2004 - Septembre 2005
Génétique et Gestion de la Biodiversité
DEUG, Licence & MaîtrisE
Université d'Avignon
Septembre 2001 - Septembre 2004
Agrosciences:
Phytoprotection et Amélioration des Productions Végétales
Le petit plus: la bonne humeur
Mon tempérament est un réel atout dans mes collaborations: je sais naturellement rendre l'ambiance de travail harmonieuse, avec un soupçon d'humour, beaucoup de sérieux et une pincée de convivialité!